Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb3P54285 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms