Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lbx1P52955 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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