Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms