Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx2P48379 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rfx2P48379 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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