Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VdrP48281 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VdrP48281 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VdrP48281 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VdrP48281 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms