Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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