Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TfamP40630 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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