Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms