Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn11P35235 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms