Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ptk2P34152 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptk2P34152 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ptk2P34152 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms