Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms