Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vcam1P29533 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vcam1P29533 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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