Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprmP28828 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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