Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NapbP28663 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NapbP28663 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NapbP28663 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NapbP28663 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NapbP28663 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NapbP28663 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NapbP28663 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms