Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms