Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms