Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psmb9P28076 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms