Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms