Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PparaP23204 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PparaP23204 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms