Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RarbP22605 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RarbP22605 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RarbP22605 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RarbP22605 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RarbP22605 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms