Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc2P20801 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnnc2P20801 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms