Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms