Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TP20293 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TP20293 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TP20293 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TP20293 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TP20293 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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