Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ntf3P20181 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms