Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NelfeP19426 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms