Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18528 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18528 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18528 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18528 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms