Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spi1P17433 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms