Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calb1P12658 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms