Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Becn2P0DM65 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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