Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a2P08122 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms