Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P04214 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P04214 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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P04214 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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P04214 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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P04214 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04214 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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