Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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