Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ClppO88696 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ClppO88696 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ClppO88696 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ClppO88696 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ClppO88696 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ClppO88696 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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