Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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