Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajb6O54946 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Dnajb6O54946 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Dnajb6O54946 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Dnajb6O54946 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Dnajb6O54946 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnajb6O54946 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms