Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn5O54942 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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