Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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CrxO54751 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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CrxO54751 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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CrxO54751 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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CrxO54751 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms