Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cavin1O54724 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cavin1O54724 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms