Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl25O35903 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ccl25O35903 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms