Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sp100O35892 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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