Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms