Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stag2O35638 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms