Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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H2-Q1O19441 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Q1O19441 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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H2-Q1O19441 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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