Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Casq1O09165 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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