Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hps1O08983 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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