Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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