Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20939L7N243 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20939L7N243 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms