Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8298J3QPI0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8298J3QPI0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms