Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm5849J3QPE5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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