Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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